Zostava prototypov dosiek plošných spojov (PCB) je takmer identická s montážou celej série dosiek plošných spojov, pričom najväčší rozdiel spočíva v počte používaných dosiek plošných spojov. Veľa častí generuje teplo v DPS, takže vynálezca by si mal vypočuť pokyny výrobcu o rozmiestnení dielcov v zostave prototypu DPS. Väčšina dosiek plošných spojov je vyrobená tak, aby plnili určitú úlohu, a optimalizácia dosky plošných spojov pre túto úlohu môže posilniť prototyp. Pri montáži prototypu dosky plošných spojov je z bezpečnostných dôvodov najlepšie nechať priestor okolo okraja. Niektoré súčasti dosky plošných spojov musia byť umiestnené v špecifickej oblasti a je ľahšie ich umiestniť ako prvé.
Zatiaľ čo prototyp PCB je taký, ktorý nie je na trhu, vo všeobecnosti existuje veľa komerčne dostupných častí používaných na zostavenie prototypu PCB. Mnohé z týchto súčastí sa dodávajú s pokynmi výrobcu, v ktorých sa uvádza, ako ďaleko by sa tieto diely mali od seba umiestniť, aby sa zabezpečilo, že teplo generované každou časťou nezničí komponenty v okolí. Normálne je najlepšie postupovať pri montáži prototypu DPS; inak môže mať doska veľmi krátku životnosť.
