Výber najlepšieho prototypového materiálu pre váš konkrétny produkt alebo vynález závisí od mnohých faktorov vrátane rozpočtu, prezentácie, časového rámca a množstva. Konečná funkcia prototypovej časti alebo produktu zvyčajne určuje materiál, z ktorého je vyrobený prototyp. Zostavenie funkčného prototypu môže byť také jednoduché, že spolu dláždia niekoľko jednoduchých materiálov alebo predmetov nachádzajúcich sa okolo domu. Materiály použité pri rýchlom prototypovaní (RP) môžu poskytnúť podrobnejší prototyp potrebný na prezentáciu investorom, inžinierom, obchodníkom, dizajnérom alebo výrobcom. Medzi ďalšie prototypové materiály patria vzory vyrobené zo silikónových foriem a rôznych druhov plastov alebo kombinácií živíc a iných materiálov.
Prototypom môže byť spočiatku drevo, hlina, živica alebo kombinácia týchto a iných materiálov. Pred rozhodnutím, aké prototypové materiály alebo procesy sa použijú, zvážte náklady. Niektoré z najúspešnejších produktov boli pôvodne vyrobené z veľmi surových prototypových materiálov alebo predmetov nachádzajúcich sa okolo domu, ako sú kartón, drôty a lepiace pásky. Pokiaľ ukazuje, ako produkt funguje, pre prototyp sa môže použiť akýkoľvek druh materiálu. Jedným typom lacného prototypového materiálu je špeciálny plast, ktorý sa po zahriatí v mikrovlnnej rúre alebo so sušičom vlasov stáva mäkkým a tvarovateľným.
